Внутренняя SEO оптимизация это, обычно, работы над сайтом по результатам SEO аудита, такие как уменьшение времени ответа сервера, оптимизация размера изображений, настройка редиректов, исправление ошибок страниц 3хх/4хх/5хх, уменьшение количества запросов к серверу, настройка кэширования статический файлов (js/css/изображений).